O laboratório multidisciplinar da escola conta com vários equipamentos científicos das áreas de física, química e biologia. Este é um importante suporte para as aula das ciências naturais. Sobre coordenação do Professor Cleiton Araujo, este espaço desenvolve diferentes projetos, tais como o Clube de Ciências, Semana do Meio Ambiente e o Basquete Escolar. Mais recentemente, foi agraciado com financiamento da FAPESPA para realizar pesquisas na área de biologia. Todos estão convidados a participar e cuidar deste espaço.
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